你知道核酸电泳实验问题有哪些吗？该如何解决呢？让我们一起来看看吧！

一、无条带或几乎看不到条带

原因：

1.上样染料掩盖目标条带；

2.凝胶超限运行；

3.电极反接；

4.染色敏感度低；

5.光源错误。

解决方法：

1.检查电泳中使用的加载染料的表观迁移大小。因为染料可能会掩盖和隐藏目标条带，特别是在样品量低的情况下。

2.监测加载染料的运行时间和迁移，以避免将较小的样品分子从凝胶上运走。

3.确保将电极正确连接至电源。设置水平凝胶时，凝胶孔应与负极位于同一侧。

4.检查制造商提供的用于检测核酸的荧光染色剂的灵敏度。

增加染色剂用量和/或延长染色时间，使单链核酸显色。或者，考虑对单链分子 具有 更高亲和力的du特染色，以提高检测的特异性和灵敏度。

对于较厚或高百分比凝胶，应延长染色时间，以确保荧光染色剂充分渗透。

5.如果使用荧光染料进行染色，请检查其激发波长以确保使用的光源对刺激染料进行可视化来说是最佳的。

二、条带拖尾或扩散（模糊）

原因：

1.上样孔形成不佳；

2.样品超载；

3.样品溶于高盐缓冲液；

4.样品含有大量蛋白质。

解决方法：

1.灌注凝胶前，应适当清洁凝胶梳。

不可将凝胶槽填充过满，否则会导致上样孔连接。

移除凝胶梳之前，应预留足够的上样孔形成时间。

2. 在凝胶电泳中，不可使用过量样品；每1毫米的凝胶孔宽度通常推荐0.1–0.2 μg的样品用量。而拖尾、弯曲或U形条带以及融合条带均是过载凝胶的常见表现。

3. 检查加载缓冲液的盐浓度是否与选定的凝胶兼容。如有需要，可稀释上样缓冲液。

4. 存在于样品中的蛋白质可能会干扰凝胶中的样品迁移率。通过纯化样品来去除蛋白质，或者通过在装有SDS的加载染料中制备样品并在加载之前加热来分离/变性蛋白质。

三、条带分离不佳

原因：

1. 未选择最佳的凝胶类型

2. 凝胶类型错误

3. 电压过低或过高

4. 电泳时间过短或过长

解决方法：

1. 选择更适合分离样品的凝胶类型。推荐使用聚丙烯酰胺凝胶来解析核苷酸<1,000 bp。

2. 对于单链核酸（例如RNA）的电泳，制备用于有效分离的变性凝胶。对于双链DNA的电泳，应避免使用变性凝胶，以保护双链结构。

3. 施加电压为建议的核酸的大小范围和使用的运行缓冲液。电压过低或过高，都无法实现最佳的核酸分离。

4. 足够长的运行凝胶以确保充分分离条带。但电泳时间不宜过长，否则会导致过度加热、样品变性和条带扩散。

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