产品介绍微生物群落多样性分析是指利用二代高通量测序技术，对微生物的16S rDNA、18S rDNA以及ITS高变区域，或者功能基因进行测序，分析环境中细菌、古细菌以及真菌的种类组成和含量，揭示环境样品中微生物种类以及它们之间的相对丰度和进化关系，进一步探讨微生物多样性；对于研究微生物与人类医疗健康、食品安全、环境检测与治理、微生物资源的利用等有着重要的理论和现实意义。产品分类16S rDNA测序：16S rDNA为编码原核生物核糖体小亚基rRNA的DNA序列，存在于所有细菌染色体基因中，共包括9个可变区和10个保守区，保守序列区域反映了生物物种间的亲缘关系，而高变序列区域则能体现物种间的差异。采用HiSeq或的MiSeq测序仪，对16S rDNA某个高变区进行测序，进一步分析环境微生物中细菌或古细菌的多样性。18S rDNA测序：18S rDNA为编码真核生物核糖体小亚基rRNA的DNA序列。在结构上分为保守区和高变区，保守区反映生物物种间的亲缘关系，高变区反映物种间的差异。ITS测序：ITS分为两个区域：ITS1/ITS2，其中ITS1位于真核生物核糖体rDNA序列18S和5.8S之间，ITS2位于真核生物核糖体rDNA序列5.8S和28S之间。ITS序列由于自然选择压力小，因此在进化过程中能够承受更多的变异，通过对ITS1或者ITS2进行测序，可分析环境微生物中真菌的多样性。技术流程技术参数测序平台：HiSeq2500；MiSeq测序策略：PE250测序周期：25-40工作日测序数据：不低于合同规定数据量标准数据分析● 原始测序数据预处理 ● 稀释曲线（Rarefaction Cur ve） ● OTU划分&OTU注释&物种分类注释 ● 物种系统发育树● 多样性指数分析 ● 物种组成统计热图 ● 群落结构：OTU分类 ● 物种丰富程度&均匀程度（Rank Abundance曲线）● 主成分分析（Principal component analysis， PCA）深度数据分析● 多样品OTU分布网状图（Network） ● 单因素方差分析 ● 多样品O TU分布比较（Venn图）● 多样品（微生物群落）分层聚类UPGMA ● 样本聚类UP GMA可靠性Support分析● 主坐标分析PCoA（2D/3D）图 ● 基于Unifrac 距离的箱型图（Box-Plot）分析● 含分类单元主坐标分析PCoA图（3D Bi-Plot） ● 差异对比NMD S分析● 冗余分析RDA（线性模型）/典型对应分析CCA（单峰模型） ● 含多样品分类饼图● LEfSe分析（组间比较分析） ● Adonis组间比较分析（基于Unifrac距离矩阵）引物信息样本要求粪便：采集新鲜粪便样品于无菌容器中，每份样品5g左右即可，液氮速冻3-5min，-80°C长期保存，干冰运输。土壤：采集土壤样本5g左右无菌容器中，液氮速冻3-5min，然后转移-80°C 或液氮中长期保存，干冰运输。污泥：采集污泥样本于无菌容器中，每份样品5g左右即可，液氮速冻3-5min， -80°C长期保存，干冰运输。水体：1、对于水质较为清澈的水样，用0.22μm 的微孔滤膜真空过滤水样（1 L左右），富集于无菌管中，液氮速冻3-5min，干冰运输。2、对于水质较为混浊的水样，三点水样混合摇匀后取60-80mL，液氮速冻3-5 min，-80℃保存，干冰运输。皮肤：采用无菌棉签轻轻刮取皮肤表面，取样后将棉签置于无菌的离心管，液氮速冻3-5min，-80℃长期保存，干冰运输。服务流程1、提交项目课题相关需求和资料。2、与我们的专业技术团队讨论项目细节。3、根据讨论后的意见对实验方案进行修改。4、双方均满意并达成一致，签订技术服务合同。5、开展实验，按期完成合同规定的内容。6、结题，提供实验原始结果和分析结果、实验流程、实验条件等等。我们的优势1、适用于单细胞、微量细胞样品。2、数据质量高、偏差小、高度均一。3、高通量，单个样本可达30-100X的测序深度和数据产出量。4、*的覆盖度，能检测到90%以上的SNP位点信息。5、检测灵敏度和准确度高。6、能够全面发掘新的和稀有的遗传变异咨询与订购感谢您选择我们的服务，如果您有任何问题，请联系我们，我们将竭诚为您解答和服务。